@Styan в архиве 2 одинаковых, вплоть до хеш-сумм, файла webp.
Модуль сам по себе ничего не конвертирует, этим занимаются библиотеки GD / imagick на сервере (то же делает и CS-Cart).
Посмотрите в phpinfo на их версии, может стоит их обновить.
Также в config.local.php есть такой твик:
'image_resize_lib' => 'auto', // library to resize images - "auto", "gd" or "imagick"
Попробуйте выставить принудительно или одно, или другое - посмотрите, будет ли разница.
Разумеется после этого стоит очищать кеш миниатюр и CS-Cart, и модуля, чтобы они заново сконвертировались.
В целом, ничего больше посоветовать не могу.